在開發高性能永磁同步電機過程中，取得成果的同時，也得到了一些問題，有待于更深入地研究和探索。
1、不可逆退磁問題
如果設計或使用不當，永磁同步電機在過高（釹鐵硼永磁）或過低（鐵氧體永磁）溫度時，在沖擊電流產生的電樞反應作用下，或在劇烈的機械振動時有可能產生不可逆退磁，或叫失磁，使電機性能下降，甚至無法使用。因此，既要研究開發適用于電機制造廠使用的檢查永磁材料熱穩定性的方法和裝置，又要分析各種不同結構型式的抗去磁能力，以便設計和制造時，采用相應措施保證永磁同步電機不失磁。
2、成本問題
鐵氧體永磁同步電機由于結構工藝簡單、質量減輕，總成本一般比電勵磁電機低，因而得到了廣泛應用。由于稀土永磁目前的價格還比較貴，稀土永磁電機的成本一般比電勵磁電機高，這需要用它的高性能和運行費用的節省來補償。在設計時既需要根據具體使用場合和要求進行性能、價格的比較后取舍，又要進行結構工藝的創新和設計優化，以降低成本。
3、控制問題
永磁同步電機不需外界能量即可維持其磁場，但這也造成從外部調節、控制其磁場極為困難。但是隨著MOSFET、IGBT等電力電子器件和控制技術的發展，大多數永磁同步電機在應用中，可以不進行磁場控制而只進行電樞控制。設計時需把永磁材料、電力電子器件和微機控制三項新技術結合起來，使永磁同步電機在嶄新的工況下運行。此外，以永磁同步電機作為執行元件的永磁交流伺服系統，由于永磁同步電機本身是具有一定非線性、強耦合性和時變性的系統，同時其伺服對象也存在較強的不確定性和非線性，加之系統運行時易受到不同程度的干擾，因此采用先進控制策略、先進的控制系統實現方式，從整體上提高系統的智能化和數字化水平，這應是當前發展高性能永磁同步電機伺服系統的一個主要突破口。
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